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Gaggle Chrome Goose

1.1.0.5
2024-05-22
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插件介绍

解析网页以获取 Gaggle 数据并与其他 Gaggle Geese 交互

ChromeGoose 是一个 Chrome 浏览器插件,用于通过在所有组件之间实现无缝数据交换来集成生物信息学分析脚本、可视化工具以及桌面和 Web 资源。

大多数生物数据类型的分析需要不同的桌面分析软件(例如 Cytoscape、MeV、R)、网络资源(例如 NCBI Entrez、EMBL String)以及用于操作、分析和可视化数据的自定义脚本。 ChromeGoose 提供了一个统一的框架,通过明确定义的数据类型将所有这些组件连接起来,从而利用它们的强大功能。这些数据类型包括之前由 Gaggle 框架定义的 NameList、Matrix、Tuple 和 Network。各种桌面分析包、Web 资源和自定义脚本可以轻松插入 ChromeGoose 架构,并避免所有数据不兼容问题。

ChromeGoose 目前的实现集成了 Chrome、Cytoscape、MeV 和 R 之间的连接。此外,基于 OpenCPU 包,任何 R 脚本都可以轻松插入到该框架中。我们已经实现了三个 R 脚本,用于监管网络模型的自定义分析,包括数据绘制、过滤和执行富集分析。

ChromeGoose 由系统生物学研究所的 Baliga 实验室开发。


插件详情

评分
4星(共5星),共4位用户参与评分
使用人数
489+ 位用户
版本
1.1.0.5
文件大小
595KB
提供方
支持语言
美国英语)
ID
loehpehjfhocaekdfacfkjbiohohafgb
发布时间
2024-05-22 19:13:56
1 / 5